Місія музею визначена положеннями офіційного документу, яким є статут Музею Війська Польського - головної установи "Катинського музею". Метою Музею є збереження зібраних національних культурних артефактів, пов'язаних з історією польського війська, їх належне утримання та надання доступу до них з науковою, дидактичною та освітньою метою, щоб вони служили науці та популяризували знання про польську військову історію.

Катинський музей належить до унікального типу музеїв - історико-мартирологічних, тобто таких, завданням яких є представлення Катинського розстрілу за допомогою "конкретних" матеріальних реліквій [музеалій-реліквій, витягнутих з ям смерті - в Катині, Харкові та Мідному] і численних документів - в постійній експозиції музею. Єдиний серед національних музеїв, через свою постійну експозицію в освітній роботі Музей намагається реалізувати програму, що доповнює історичну освіту суспільства, особливо молодого покоління, та формує патріотичні настрої, висвітлюючи всі аспекти, що стосуються долі поляків на Сході після 17 вересня 1939 року.